Zajrzałeś chociaż do FAQ?
1. Musisz mieć wyrobiony certyfikat dla swojego telefonu (plik *.cer i *.key).
2. Ściągasz aplikacje, którą chcesz podpisać.
3. Odpalasz program SignSIS i w I polu wprowadzasz aplikację, w II plik *.cer z punktu nr 1 i w III polu plik *.key z pkt 1.
4. Klikasz na Sign the SIS i wrzucasz na telefon podpisaną aplikację (podpisany plik utworzy się w tym samym miejscu, co niepodpisana aplikacja; nazwa też będzie taka sama, tyle że napisana CAPS LOCKIEM).